Genetik Dizilimleme ve Testleri Eğitimi

Bu, temel düzeyde biyoinformatik bilgilerini sunan uygulamalı bir çalıştaydır. Moleküler biyoloji alanında temel bir biyolojik geçmişe ve bilgi birikimine sahip olup, hesaplama araçlarını kullanarak biyolojik verileri nasıl işleyeceğini ve üzerinde çalışacağını öğrenmek isteyen kişilere yöneliktir. Özellikle şunlar için tasarlanmıştır:

• Biyolojik makromoleküller (proteinler, RNA ve DNA) üzerinde deneysel laboratuvarlarda çalışan araştırmacılar.
• Asıl uzmanlık alanı biyoloji olmayan ancak biyolojik verilerle başa çıkması gereken bilim insanları.
• Yeni ürünler (örneğin ilaçlar) tanıtan ve günümüz biyoinformatiği hakkında bilgi edinmek isteyen yöneticiler.
• Biyolojik moleküllerle ilgili programlar yazacak olan bilgisayar programcıları.

Kurs, teorik ve pratik olmak üzere iki bölüme ayrılmıştır. Ders, katılımcıların kavramları anladığından emin olmak için basit pratik egzersizler, sınavlar ve testlerle iç içe geçmiştir.

Eğitim sırasında, biyolojik veri analizinin tüm temel yönlerini kapsayan rehberli bir tura katılacaksınız. Bu çalıştay, biyoinformatiği ve birçok yüzünü tanımak için ideal bir fırsattır! Kursun sonunda, herhangi bir temel biyoinformatik problemini çözebileceksiniz: gerekli verileri nereden alacağınızı, ilgili bilgilere nasıl ulaşacağınızı ve temel yazılım ve algoritmaların nasıl çalıştığını bileceksiniz. Amacımız, biyolojik verileri anlamanızı kolaylaştırmaktır.

Kursun sonunda, biyoinformatik araçlarını kullanarak biyolojik verilerle çalışabileceksiniz.

Good Klinik Uygulamaları (GCP), insan denekler üzerinde yapılan klinik araştırmalar için bir dizi kılavuzdur. GCP, klinik deneylerin tasarımı, yürütülmesi, izlenmesi, belgelenmesi, analizi ve raporlanması için uluslararası standart olarak hizmet eder.

Bu eğitmen liderliğindeki canlı eğitimde, katılımcılar insan denekleri içeren klinik deneyler ve araştırmalar için Good Klinik Uygulamaları (GCP) ile ilgili en önemli kılavuzları ve temel ilkeleri öğreneceklerdir. Bu kurs, farklı GCP alanlarına genel bir bakış sunar, ancak özellikle Araştırma İlaçları ve Biologikler için ICH merkezli GCP'ye biraz daha odaklanır.

Bu eğitimin sonunda katılımcılar şunları yapabilecektir:

• Araştırma ilaçları ve biyolojikler için Uluslararası Uyum Konferansı (ICH) temelinde GCP'nin temel ilkelerini anlamak
• GCP tarafından belirtilen kılavuzları klinik araştırmalarına ve deneylerine uygulamak

Hedef Kitle

• Klinik araştırmacılar
• Klinik araştırma uzmanları
• Sağlık ve tıp uzmanları
• Klinik deney destek personeli
• Araştırma ve geliştirme personeli

Kurs Formatı

• Kısmen ders anlatımı, kısmen tartışma, egzersizler ve yoğun uygulamalı çalışma

Mikrobiyal genomik ve metagenomik, mikrob topluluklarını profilleme, genomları karakterleştirme ve antibiyotik direnç gibi fonksiyonel özellikleri tespit etmek için dizileme teknolojilerini ve hesaplama analizini birleştirir.

Bu eğitmen yönetilen canlı eğitim (çevrimiçi veya yerinde) başlangıç seviyesine sahip araştırmacılar ve bioinformatikçiler için düzenlenmiştir ve mikrobiyal genomik ve metagenomik dizileme verilerinin analizini elle yapmayı amaçlamaktadır.

Bu eğitimin sonunda katılımcılar şunları yapabilecektir:

• Mikrobiyal genomikte sık kullanılan dizileme iş akışlarını ve ana dosya biçimlerini tanımlayabilmek.
• Ham NGS okumalarının kalite kontrolünü ve ön işlemini gerçekleştirebilmek.
• Marker tabanlı ve k-mer yaklaşımları kullanarak taksonomik profilleme yapabilmek.
• Mikrobiyal genomları ve plazmidleri derleyebilmek ve notasyonu yapabilmek.
• SNP'leri tespit etmek, filogenetik ağaçlar oluşturmak ve populasyon yapısını yorumlamak.
• Antibiyotik direnç genlerini tahmin edebilmek ve fonksiyonel profilleri özetlemek.
• Conda, Docker ve not defteri tabanlı raporlar kullanarak tekrarlanabilir iş akışları oluşturabilmek.

Kursun Formatı

• Kavram ve araçları tanıtan dersler (20%).
• Örnek veri kümelerini kullanarak elden geçiren pratik oturumlar (60%).
• Katılımcuların metodları kendi verilerine uygulaması için açık tartışmalar ve rehberlik (20%).

Kurs Özelleştirme Seçenekleri

• Kliniğe, çevreye veya endüstriye odaklanan özelleştirilmiş bir workshop talep etmek için lütfen bize ulaşın.

Türkiye'da (çevrimiçi veya yerel) gerçekleştirilen bu eğitmen yönetimi altında olan canlı eğitim, bilim insanları ve nanobilimin temellerini ve uygulamalarını öğrenmek isteyen herkes için tasarlanmıştır.

Eğitim sonunda, katılımcılar şunları yapabilecektir:

• Nanobilim ve nanoteknolojiler alanında bilgi sahibi olmak.
• Nano aralıklarındaki nesneleri mikro aralıklardaki nesnelerden ayırt etmek.
• Elektron ve enerji transferinin temel teorisini bilmek.

Bu kurs, programlamanın biyolojik sorunları çözme bağlamında ne kadar güçlü bir araç olduğunu gösteren uygulamalı bir kurstur. Kurs boyunca katılımcılara Python programlama dili öğretilecek; bu dil hem güçlü hem de kullanımı kolay olarak kabul edilir. Bu kurs, biyoinformatiğin biyologların yaşamlarını nasıl iyileştirdiğinin bir göstergesi olarak düşünülebilir.

Kurs, bilgisayar bilimi geçmişi olmayan ve programlamayı öğrenmek isteyen kişiler için tasarlanmış ve hedeflenmiştir.

Bu kurs şunlar için uygundur:

• Biyolojik verilerle uğraşan araştırmacılar.
• Günlük görevleri otomatikleştirmeyi ve verileri analiz etmeyi öğrenmek isteyen bilim insanları.
• Programlamanın iş akışlarını ve proje yürütmeyi nasıl iyileştirdiğini öğrenmek isteyen yöneticiler.

Kursun sonunda katılımcılar, biyolojik verileri manipüle etmelerini, analiz etmelerini ve işlemelerini sağlayacak kısa programlar yazabilecek ve sonuçları grafiksel bir formatta sunabileceklerdir.

Bu kurs, araştırmacıların bir dizi bilimsel disiplinde yapılan araştırmalara ilişkin istatistiksel tasarım ve analiz ilkelеринин anlamını kazanmalarına yönelik tasarlanmıştır.

Kurs, çoğunlukla örnekler yoluyla bazı olasılık ve istatistik yöntemleri konusunu kapsar. Bu eğitim yaklaşık %30 ders içermektedir, %70 ise yönlendirilmiş testler ve laboratuvarlar.

Kurs kapalı olduğunda örnekler ve malzemeler belirli bir dal (psikoloji denetleri, kamu sektörü, biyoloji, genetik vb.) için özelleştirilebilir.

Halka açık kurslarda ise karmaşık örnekler kullanılmaktadır.

Bu kurs sırasında çeşitli yazılımların kullanılmasına rağmen (SPSS, Statgraphics vs...), ana odak noktasını araştırmaları yönlendiren ilkeler ve süreçlerin anlayışına koyuyor.

Bu kurs hibrit bir formatta sunulabilir yani ev ödevleri ve atölye çalışmaları ile.